Im Bereich der Optik und Biophotonik kooperiert das BMO sehr eng mit dem Medizinischen Laserzentrum Lübeck (MLL). Die MLL GmbH ist eine nicht-gewinnorientierte gemeinnützige Technologietransfergesellschaft im Gebäude des BMO, die durch angewandte Forschung grundlegende Ideen und Methoden der Biophotonik und Lasermedizin, oftmals aus dem BMO, in die Wirtschaft transferiert. Das MLL bietet industriellen Partnern eine anwendungsorientierte Erforschung innovativer Methoden bis hin zur Entwicklung und Erprobung neuer potenzieller Medizinprodukte. Hierzu können klinische und vorklinische Studien mit eigenen Prototypen oder von der Industrie gestellten Systemen gemäß Medizinproduktegesetz (MPG) zusammen mit klinischen Partnern durchgeführt werden. Herausragende Expertise hat sich das MLL über viele Jahre in der optischen Diagnostik und Therapie, besonders für die Ophthalmologie und minimalinvasive Chirurgie, erworben.

Im Rahmen der Quervernetzung biophotonischer Methoden mit der klassischen, breit aufgestellten Medizintechnik am BioMedTec-Wissenschaftscampus Lübeck arbeitet das BMO eng mit dem Medizintechnik-Kompetenzzentrum TANDEM (Center of Excellence for Technology and Engineering in Medicine) zusammen.

Bezüglich der Erprobung neuer medizinischer Methoden und Geräte kooperiert das BMO mit der UniTransferKlinik Lübeck GmbH. Der im Gebäude des BMO angesiedelte voll instrumentell ausgestattete Transfer-OP steht dem UK S-H und Industriepartnern zur Nutzung zur Verfügung.